11月3日付でVMware ESXi 5.0のパッチESXi500-201111001がリリースされていますね。内容の詳細によると多くのiSCSIターゲットが存在する場合に起動時間が長くなる点の修正みたいです。
これとは別にうちの会社でホストを5.0にしてから2つあるうちの1つのホストでディスクの最大待ち時間が従来の10倍以上になりまして、ログにも待ち時間が大きすぎるとの警告が保存されていました。結局、ホストを再起動しておさまったような感じなんですが、5.0の安定性はもう少しかかるのかなと思います。
11/14 追記
ディスクの待ち時間の件ですが、ESXi 5.0が原因ではありませんでした。こちらに記述しましたように、設定変更後のハブのリセットが必要だったみたいです。